Input paired dataset collection in workflow

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Input paired dataset collection in workflow

Previti

Dear Galaxy Community,

Is there a way to input a paired dataset collection into a workflow?

I would like to build a workflow using cutadapt with a paired dataset collection but...I'm missing something.

I have seen workflows (at usegalaxy.eu for example: 1_CLIPseq-Explorer_demulti_PEAKachu_iCLIP_hg19) where this is possible.

But how is this done practically?

Thanks and best regards,

Christopher


Genomics and Proteomics Core Facility
High Throughput Sequencing (W190)
Bioinformatician

German Cancer Research Center (DKFZ)
Foundation under Public Law
Im Neuenheimer Feld 580
69120 Heidelberg
Germany
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Phone: +49 6221 42-4434

christopher.previti@...
www.dkfz.de

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Re: Input paired dataset collection in workflow

Previti
I got it, sorry to bother you.
One can actually specify the type of collection...and set it to list of dataset pairs.
Best regards,
Christopher


Am 24.01.19 um 10:19 schrieb Christopher Previti:

Dear Galaxy Community,

Is there a way to input a paired dataset collection into a workflow?

I would like to build a workflow using cutadapt with a paired dataset collection but...I'm missing something.

I have seen workflows (at usegalaxy.eu for example: 1_CLIPseq-Explorer_demulti_PEAKachu_iCLIP_hg19) where this is possible.

But how is this done practically?

Thanks and best regards,

Christopher


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